湄洲妈祖庙建于宋初，开始仅“落落数椽”，名叫“神女祠”，经过多次修建、扩建才形成规模的。其中郑和、施琅等历史名人就力主扩建过，形成建筑规模，日臻雄伟，后形成了以正殿、偏殿等五组建筑群，16座殿堂楼阁，99间斋舍客房；画梁雕栋，金碧辉煌，恰似“海上龙宫”。后来庙宇几经损坏，日渐破败，特别是“文化大革命”期间（1966－1968年），妈祖庙受到了严重的毁坏，几乎“夷为平地”。 八十年代来，妈祖庙才陆陆续续开始重建，尤其是近十年来，台湾妈祖信徒到湄洲岛祖庙进香日渐增多，目睹妈祖庙的现状，海峡两岸妈祖信徒同心协力，自愿捐物捐资，进行大规模的修复兴建。如今，湄洲妈祖庙不但重显光彩，而且建筑规模远远超过了历史任何时候，更加富丽堂皇。