长林岛湿地地处祖国东北边陲的黑龙江省宝清县五九七农场第四管理区境内。1990年，经黑龙江省国营农场总局批准，黑龙江省长林岛自然保护区正式成立。1997年9月经黑龙江省人民政府批准晋升为省级自然保护区。2001年通过晋升国家自然保护区专家组认证。