青莲寺为瑞穗乡乡民传统信仰中心，前身为兴建于清光绪年间的慈圣宫，为一简陃之茅草。1924年（大正13年）改建为三厅二院的砖瓦建筑，并改为今名。其后经多次修建，于1986年（民国75年）始整建完善，建材多采用瑞穗当地盛产的蛇纹石，极富地方特色。寺内除奉祠传统佛、道神祈外，还供奉著一个年代久远的镇寺之宝——“竹笼”。