清华洞是祥云县发现的比较早的人类居住遗址之一，为滇西5000年新石器人类文明的典型洞穴遗址。 清华洞属喀斯特地形石岩溶洞，洞分前洞、后洞。前洞深、宽约30余米，高5米；后洞分二支，深不可测，洞内石花、石笋、石柱甚多，琳琅满目。前洞口右侧顶穹正中，仰视见尺余椭圆形亮光通山顶，称“碟大天”。右侧有小洞3个，时宽、时窄，洞壁大洞套小洞数十个。前洞中主洞位于洞口正中。洞内怪峰突兀、石笋倒挂、悬崖滴乳、落水有声。洞口壁上方有摩岩石刻，计24块，多为明代以来的宫吏及骚人墨客所作。