主要保护对象白蝶贝亦称大珠母贝，为国家二级野生保护动物。保护区内水生动物资源丰富，有7门18纲57目209科599种。此外还保护本区内的黑蝶贝、马氏珠母贝、企鹅珍珠贝、华贵栉孔扇贝、江珧、蚶类、长竹蛏、棒锥螺等生物多样性资源。