城子崖遗址博物馆馆内有三个展厅。一展厅突出陈列了龙山西河遗址出土的文物，以红陶器为主，距今约8000多年。展出的文物有陶釜、圈足碗、磨盘、棒等，造型独特，古韵尚存；二展厅是龙山文化展厅，突出展示了城子崖遗址两期发掘的重大成果。 展出的文物有陶器、石器、蚌器、骨角器等。在诸多的陶器中尤以鸟头陶器较典型，还有早已闻名遐迩的蛋壳陶高柄杯，以其“黑如漆，亮如镜，薄如纸，硬如瓷，掂之飘忽若无，敲之铮铮有声，”被世界各国誉为“四千年前地球文明精致之制作”；在第三展厅，岳石城墙密集的夯窝，平陵城的铁双箭，汉代人面瓦当，不同时期的文物异彩纷呈。