三元宫，又名海宁禅寺，是花果山上较大的古建筑群。它倚山而建，气势雄伟。该寺发迹于唐，重建于宋，敕赐于明。寺院正门前拱额“敕赐护国三元宫”为道光皇帝的亲笔手书。寺内藏有一块明神宗万历三十年（1602年）所颁的圣旨碑，上面记载着将其封为“天下名山寺院”之一的内容。如今的三元宫已是远近闻名的佛教胜地，终年香火缭绕，游客如云。